Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTX2P32243 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTX2P32243 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTX2P32243 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
OTX2P32243 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTX2P32243 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTX2P32243 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms