Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFNP31947 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFNP31947 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SFNP31947 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFNP31947 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms