Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR1FP30939 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms