Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms