Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms