Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms