Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL1P22362 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms