Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC1P18754 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC1P18754 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms