Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MUC1P15941 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUC1P15941 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms