Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms