Protein–RNA interactions for Protein: P11308

ERG, Transcriptional regulator ERG, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGP11308 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERGP11308 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERGP11308 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERGP11308 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERGP11308 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERGP11308 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERGP11308 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERGP11308 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms