Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms