Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms