Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms