Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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