Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13BP05160 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13BP05160 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13BP05160 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms