Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms