Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSD2O96028 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NSD2O96028 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSD2O96028 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSD2O96028 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSD2O96028 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NSD2O96028 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSD2O96028 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms