Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCKDKO14874 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BCKDKO14874 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms