Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F3O00716 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F3O00716 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms