Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DFFAO00273 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DFFAO00273 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DFFAO00273 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms