Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms