Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms