Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C1D1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C1D1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C1D1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C1D1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C1D1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1D1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1D1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1D1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1D1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms