Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms