Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E9PBE3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E9PBE3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E9PBE3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E9PBE3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E9PBE3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
E9PBE3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
E9PBE3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
E9PBE3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms