Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms