Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DGG1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DGG1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DGG1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DGG1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DGG1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DGG1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DGG1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DGG1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DGG1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms