Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms