Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms