Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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