Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB11Q9Y547 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms