Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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