Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT52Q9Y366 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms