Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PALD1Q9ULE6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms