Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP21Q9UK80 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms