Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms