Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms