Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms