Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms