Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms