Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms