Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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SH3BP4Q9P0V3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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