Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms