Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms