Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPF1Q9NWY4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms