Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms