Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms