Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms