Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms